Je réponds à ma propre question puisque j'ai acheté mon Shuttle. Après plusieurs essais, la carte la plus puissante que l'on puisse y mettre est la Leadtek GeForce 8600GTS.
Les 8800 sont double slots donc trop épaisses. Les 8600GTS à refroidissement passif sont également trop larges, en raison du ventirad.